Seit 1996 besteht das Schulorchester des Musikgymnasiums Carl- Philipp- Emanuel- Bach Berlin. Es ist ein großes Sinfonieorchester, in dem die Schülerinnen und Schüler Erfahrungen für das Orchesterspiel sammeln können. Im Mittelpunkt der Arbeit stehen die großen Werke der klassischen Komponisten: die Sinfonien und Ouvertüren von Beethoven, Mozart, Mendelssohn; die Komponisten der Romantik (Schubert u.a.), aber auch viele Komponisten der Gegenwart, wie Gershwin, Schulhof, Bartok und Strawinsky.
Durch die Umgestaltung der Proben im Orchester mit Einführung von Orchesterfahrten und phasenartigen Proben im Kontrast zum früheren Wochen-Probenrhythmus konnten die Ergebnisse und der Spaßfaktor bei den Orchesterproben erheblich gesteigert werden. Als Höhepunkt der Arbeitsphasen findet einmal jährlich im Februar ein Konzert in der französischen Friedrichstadtkirche statt. Den Jahreshöhepunkt bildet das Sommerkonzert im Juni bzw. Juli im Kammermusiksaal der Philharmonie.
Unser Dirigent ist Tilo Schmalenberg, der das Orchester seit 1996 kontinuierlich betreut. Die Registerproben werden von qualifizierten Dozenten der Musikhochschulen geleitet.
Das Repertoire wird in Zusammenarbeit mit den Jugendlichen vom Dirigenten ausgewählt. 
Seit einigen Jahren hat es sich so eingespielt, dass die Schüler der 13. Klasse, die im Orchester nicht mehr mitspielen, zum Abschluss ein Solokonzert mit Orchester bekommen.
Seit dem Sommer 2007 gibt es auch einen Chor am Musikgymnasium, der gemeinsam mit dem Orchester das große Sommerkonzert bestreitet.
Der Chordirigent ist Jens Bauditz.